More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1357 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0744  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 1212 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1357  ABC transporter related  100 
 
 		 1218 aa  2323    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.572904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20960  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.67 
 
 		 1175 aa  622  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2806  ABC transporter related  39.89 
 
 		 1185 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1525  ABC transporter related  43.96 
 
 		 1176 aa  328  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.910537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3550  ABC transporter related  46.32 
 
 		 1155 aa  320  7.999999999999999e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00603168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.31 
 
 		 760 aa  202  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 582 aa  202  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 582 aa  202  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 582 aa  202  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2086  ABC transporter related  33.13 
 
 		 592 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  29.85 
 
 		 604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 615 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  30.52 
 
 		 619 aa  197  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.27 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.54 
 
 		 597 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  27.88 
 
 		 582 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.19 
 
 		 582 aa  191  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 600 aa  191  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5762  ABC transporter related  29.85 
 
 		 589 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 		 582 aa  190  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 598 aa  189  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 636 aa  189  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  31.59 
 
 		 592 aa  189  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.78 
 
 		 618 aa  189  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  26.82 
 
 		 610 aa  188  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.63 
 
 		 582 aa  187  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  29.39 
 
 		 594 aa  187  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  30.28 
 
 		 632 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.66 
 
 		 727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  29.4 
 
 		 1264 aa  186  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 590 aa  186  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.38 
 
 		 582 aa  186  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.01 
 
 		 721 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.17 
 
 		 734 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.02 
 
 		 582 aa  185  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 582 aa  185  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.98 
 
 		 614 aa  185  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.95 
 
 		 582 aa  184  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  184  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  31.32 
 
 		 580 aa  184  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 620 aa  183  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  29.89 
 
 		 597 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  28.46 
 
 		 601 aa  183  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.93 
 
 		 734 aa  183  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.61 
 
 		 582 aa  183  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  28.36 
 
 		 598 aa  183  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.49 
 
 		 556 aa  183  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2412  ABC transporter related  29.07 
 
 		 602 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.54 
 
 		 727 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  36.27 
 
 		 607 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.93 
 
 		 583 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  33.89 
 
 		 602 aa  182  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.77 
 
 		 782 aa  182  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  29.72 
 
 		 597 aa  182  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  29.78 
 
 		 632 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  30.89 
 
 		 521 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  30.02 
 
 		 632 aa  182  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  32.06 
 
 		 581 aa  181  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  34.32 
 
 		 581 aa  181  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.01 
 
 		 601 aa  181  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  27.1 
 
 		 576 aa  180  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  29.68 
 
 		 602 aa  180  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  24.75 
 
 		 597 aa  181  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  29.2 
 
 		 546 aa  180  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  28.73 
 
 		 598 aa  180  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  29.45 
 
 		 575 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0735  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.2 
 
 		 582 aa  179  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  26.97 
 
 		 590 aa  179  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  32.68 
 
 		 1301 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.63 
 
 		 592 aa  179  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  29.5 
 
 		 586 aa  179  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2087  ABC transporter related  31.3 
 
 		 579 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  30.8 
 
 		 598 aa  178  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.21 
 
 		 608 aa  179  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.32 
 
 		 721 aa  179  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  29.72 
 
 		 614 aa  178  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.47 
 
 		 582 aa  177  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  31.96 
 
 		 593 aa  177  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.95 
 
 		 738 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  28.6 
 
 		 578 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  29.08 
 
 		 603 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 		 586 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  30.19 
 
 		 637 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  29.59 
 
 		 580 aa  175  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  31.01 
 
 		 620 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>