More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3550  ABC transporter related  52.71 
 
 		 1155 aa  927    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00603168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1525  ABC transporter related  59.88 
 
 		 1176 aa  1176    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.910537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0744  ABC transporter related protein  57.12 
 
 		 1212 aa  1165    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2806  ABC transporter related  59.8 
 
 		 1185 aa  1165    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20960  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 1175 aa  2237    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1357  ABC transporter related  40.07 
 
 		 1218 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.572904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2087  ABC transporter related  30.86 
 
 		 579 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  29.78 
 
 		 583 aa  218  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  26.38 
 
 		 1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.79 
 
 		 635 aa  212  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.14 
 
 		 619 aa  208  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  36.36 
 
 		 598 aa  208  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 600 aa  207  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 636 aa  206  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  29.22 
 
 		 1228 aa  206  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  33.08 
 
 		 595 aa  206  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.8 
 
 		 602 aa  204  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.06 
 
 		 582 aa  204  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  31.46 
 
 		 632 aa  204  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00404  AtrH [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2VY21]  26.48 
 
 		 1324 aa  204  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.173354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  27.91 
 
 		 610 aa  203  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.79 
 
 		 609 aa  202  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.98 
 
 		 614 aa  202  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  30.7 
 
 		 606 aa  202  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.72 
 
 		 582 aa  201  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  29.15 
 
 		 640 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.66 
 
 		 582 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  28.96 
 
 		 587 aa  200  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  27.69 
 
 		 618 aa  199  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.94 
 
 		 597 aa  197  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06171  putative multidrug efflux ABC transporter  36.05 
 
 		 598 aa  197  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  27.63 
 
 		 598 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.4 
 
 		 614 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.52 
 
 		 596 aa  195  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  36.36 
 
 		 597 aa  195  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 576 aa  195  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  31.24 
 
 		 592 aa  194  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  28.52 
 
 		 1138 aa  194  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 615 aa  194  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.54 
 
 		 620 aa  194  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0561  multidrug ABC transporter  35.74 
 
 		 598 aa  194  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.793033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1070  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.57 
 
 		 577 aa  194  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00802304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  30.55 
 
 		 608 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.79 
 
 		 586 aa  194  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 590 aa  194  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.07 
 
 		 582 aa  193  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 609 aa  193  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.79 
 
 		 589 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.62 
 
 		 586 aa  193  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.37 
 
 		 1179 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 586 aa  191  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  33.12 
 
 		 577 aa  191  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32.3 
 
 		 590 aa  191  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.49 
 
 		 581 aa  191  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  31.83 
 
 		 600 aa  191  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  37.29 
 
 		 607 aa  190  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  29.16 
 
 		 567 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  28.74 
 
 		 610 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  28.74 
 
 		 610 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.44 
 
 		 586 aa  190  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.14 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  26.93 
 
 		 586 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 586 aa  189  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.97 
 
 		 567 aa  189  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  31.49 
 
 		 592 aa  189  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 663 aa  189  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.54 
 
 		 584 aa  189  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.1 
 
 		 586 aa  189  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  30 
 
 		 600 aa  188  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  27.29 
 
 		 588 aa  188  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  27.45 
 
 		 589 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  29.67 
 
 		 765 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  26.53 
 
 		 601 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  29.38 
 
 		 695 aa  187  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  29.29 
 
 		 625 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.99 
 
 		 602 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  26.06 
 
 		 591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  31.85 
 
 		 654 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  27.19 
 
 		 1218 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.39 
 
 		 598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.75 
 
 		 627 aa  186  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.65 
 
 		 618 aa  186  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>