More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1412 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
951 aa  1791    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  35.8 
 
 
954 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  36.24 
 
 
997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  34.06 
 
 
1074 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
1137 aa  303  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
1072 aa  288  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
1299 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
1045 aa  261  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
1141 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  32.87 
 
 
1112 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  33.51 
 
 
1182 aa  168  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  36.14 
 
 
1134 aa  164  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
1121 aa  155  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  30.26 
 
 
1192 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
1196 aa  144  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  45.58 
 
 
1299 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  42.45 
 
 
1713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  41.45 
 
 
1059 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  25.21 
 
 
1031 aa  103  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
298 aa  97.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
334 aa  95.1  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
329 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
822 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
836 aa  88.6  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
318 aa  88.2  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
340 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
841 aa  87.8  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
315 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.03 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
337 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
951 aa  82  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.63 
 
 
838 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
841 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
313 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
346 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  30.4 
 
 
1141 aa  77  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 
346 aa  77  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  22.42 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  20.71 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  23.65 
 
 
320 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
808 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.98 
 
 
336 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
288 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
1267 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
324 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
312 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
610 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
272 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
334 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.55 
 
 
2401 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
306 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
401 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
312 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
312 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
312 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
617 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.89 
 
 
284 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
302 aa  66.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  30.73 
 
 
1133 aa  66.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
337 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 
340 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
290 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
322 aa  65.1  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
299 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 
321 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
307 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.17 
 
 
1644 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
1644 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
366 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 
322 aa  63.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
345 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  30.67 
 
 
358 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
616 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
306 aa  62.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
775 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
287 aa  62.4  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
335 aa  62.4  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
924 aa  62  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
313 aa  62  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
306 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
358 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>