33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0747 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  100 
 
 		 1713 aa  3187    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1059 aa  328  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5862  hypothetical protein  36.3 
 
 		 525 aa  231  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000662704  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  32.72 
 
 		 954 aa  171  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 1045 aa  134  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 1072 aa  133  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  35.29 
 
 		 997 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1074 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 951 aa  117  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 1299 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 1137 aa  112  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 1141 aa  96.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 1121 aa  87.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  33.49 
 
 		 1134 aa  87.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  26.03 
 
 		 1192 aa  85.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  28.85 
 
 		 1112 aa  78.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  31.89 
 
 		 1182 aa  72.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  34.52 
 
 		 1299 aa  65.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  27.81 
 
 		 1133 aa  59.7  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  32.67 
 
 		 513 aa  58.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 355 aa  57.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  46.99 
 
 		 1196 aa  56.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 337 aa  54.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  28.14 
 
 		 489 aa  52.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 350 aa  52  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31060  hypothetical protein  38.41 
 
 		 847 aa  51.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169452  normal  0.624304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 329 aa  51.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 353 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 		 322 aa  49.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.15 
 
 		 348 aa  47.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 308 aa  47.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  48.21 
 
 		 345 aa  47.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 476 aa  45.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>