55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1860 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
1192 aa  2295    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  49.56 
 
 
1182 aa  445  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
1141 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  29.18 
 
 
1112 aa  244  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  42.26 
 
 
1196 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  26.56 
 
 
1031 aa  232  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  32.6 
 
 
954 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
1045 aa  183  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  29.42 
 
 
1299 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  26.27 
 
 
1133 aa  164  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  31.72 
 
 
1141 aa  141  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  37.14 
 
 
997 aa  129  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
951 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  43.87 
 
 
1072 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
1137 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  32.11 
 
 
1074 aa  97.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  31.1 
 
 
1134 aa  95.5  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 
951 aa  88.2  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  38.03 
 
 
1299 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  30.94 
 
 
1713 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.75 
 
 
320 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
353 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
366 aa  59.7  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
290 aa  58.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  35.88 
 
 
1121 aa  56.2  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
489 aa  55.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
679 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.91 
 
 
2401 aa  55.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
298 aa  55.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1162 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
322 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
714 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
350 aa  53.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
340 aa  53.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
401 aa  52.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
302 aa  52.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
329 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
624 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  27.08 
 
 
300 aa  48.9  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 
334 aa  48.9  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
1523 aa  48.9  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
822 aa  48.5  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  23.55 
 
 
320 aa  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
616 aa  47.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
358 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
376 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 
378 aa  46.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.73 
 
 
336 aa  45.8  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
341 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.71 
 
 
358 aa  45.8  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
355 aa  45.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
320 aa  45.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
317 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
315 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
324 aa  44.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>