43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  100 
 
 
1141 aa  2137    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
1141 aa  202  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  29.54 
 
 
1112 aa  198  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  28.24 
 
 
1192 aa  196  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  36.53 
 
 
1121 aa  169  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
1299 aa  148  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  33.9 
 
 
1182 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  36 
 
 
1134 aa  131  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  30.01 
 
 
954 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
1045 aa  108  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  27.43 
 
 
1031 aa  100  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
1196 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  41.73 
 
 
997 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  26.62 
 
 
1133 aa  92.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
1137 aa  85.9  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
1072 aa  82  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
951 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  30.32 
 
 
1074 aa  74.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  36.73 
 
 
1059 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
951 aa  56.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
489 aa  55.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.68 
 
 
1430 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.46 
 
 
322 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  31.72 
 
 
1299 aa  50.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.3 
 
 
358 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
303 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
353 aa  48.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.53 
 
 
455 aa  47  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  47.83 
 
 
1312 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
341 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
1267 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
318 aa  46.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
1267 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
288 aa  45.8  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  36.78 
 
 
1345 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  47.73 
 
 
1435 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
337 aa  45.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  29.92 
 
 
348 aa  45.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  44.9 
 
 
1403 aa  45.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.23 
 
 
1435 aa  45.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.52 
 
 
318 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.9 
 
 
1506 aa  44.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.94 
 
 
1371 aa  44.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>