23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0189 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1342 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 1435 aa  2809    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  81.45 
 
 		 1435 aa  2196    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.31 
 
 		 1506 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1403 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.39 
 
 		 1430 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.36 
 
 		 1371 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1345 aa  569  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1435 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.34 
 
 		 1404 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  36.38 
 
 		 1384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  36.32 
 
 		 1384 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  36.32 
 
 		 1384 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  34.21 
 
 		 1408 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  35.02 
 
 		 1400 aa  499  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  33.09 
 
 		 1347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1312 aa  336  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1322 aa  317  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1608 aa  191  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1672 aa  169  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  42.37 
 
 		 1121 aa  48.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1141 aa  45.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2223  hypothetical protein  22.78 
 
 		 708 aa  45.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.736108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>