22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0207 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  39.7 
 
 
1342 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
1435 aa  2788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  81.38 
 
 
1435 aa  2094    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.18 
 
 
1506 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  38.33 
 
 
1403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.37 
 
 
1371 aa  595  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  38 
 
 
1430 aa  592  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  37.61 
 
 
1345 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  36.09 
 
 
1435 aa  553  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  36.02 
 
 
1384 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  36.04 
 
 
1384 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  36.04 
 
 
1384 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.41 
 
 
1404 aa  525  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  35.13 
 
 
1400 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  34.31 
 
 
1408 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  33.2 
 
 
1347 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  34.23 
 
 
1312 aa  346  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  34.42 
 
 
1322 aa  322  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  27.27 
 
 
1608 aa  198  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  27.17 
 
 
1672 aa  178  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  43.86 
 
 
1121 aa  48.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  44.23 
 
 
1141 aa  45.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>