22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  63.69 
 
 		 1322 aa  1453    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  100 
 
 		 1312 aa  2571    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.17 
 
 		 1371 aa  439  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.31 
 
 		 1506 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.22 
 
 		 1430 aa  396  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.3 
 
 		 1404 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  35.6 
 
 		 1384 aa  367  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  35.63 
 
 		 1384 aa  364  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  35.63 
 
 		 1384 aa  364  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.87 
 
 		 1435 aa  362  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1435 aa  361  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 1408 aa  357  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1403 aa  357  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  33.3 
 
 		 1342 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  35.3 
 
 		 1400 aa  334  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  35.08 
 
 		 1347 aa  328  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1435 aa  326  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1672 aa  254  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1608 aa  238  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  43.01 
 
 		 1345 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1141 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 1299 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>