21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1471 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.71 
 
 
1506 aa  1020    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  56.29 
 
 
1371 aa  1282    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  45.63 
 
 
1403 aa  971    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  100 
 
 
1345 aa  2615    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.71 
 
 
1430 aa  854    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.97 
 
 
1435 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  37.06 
 
 
1435 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  34.93 
 
 
1342 aa  506  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  33.16 
 
 
1384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  33.16 
 
 
1384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  33.51 
 
 
1384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  33.08 
 
 
1435 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  33.05 
 
 
1408 aa  429  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.26 
 
 
1404 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  33.13 
 
 
1400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  31.6 
 
 
1347 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  35.99 
 
 
1322 aa  376  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  35.4 
 
 
1312 aa  370  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  25.41 
 
 
1608 aa  184  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  24.91 
 
 
1672 aa  158  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  34.45 
 
 
1141 aa  46.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>