105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6330 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
1299 aa  2372    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31060  hypothetical protein  49.09 
 
 
847 aa  194  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169452  normal  0.624304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  44.83 
 
 
1074 aa  145  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  45.5 
 
 
1045 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
1137 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  39.27 
 
 
954 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  39.55 
 
 
997 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
951 aa  126  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
1299 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
1072 aa  123  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  44.72 
 
 
1121 aa  115  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  43.35 
 
 
1196 aa  110  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
1141 aa  103  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  45.11 
 
 
1112 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  44.65 
 
 
1182 aa  100  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  44.08 
 
 
1059 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  35.43 
 
 
1192 aa  90.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  38.29 
 
 
1134 aa  87  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  34.03 
 
 
1713 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
841 aa  70.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
951 aa  68.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
298 aa  66.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
336 aa  66.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
836 aa  65.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 
1133 aa  64.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
286 aa  63.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
353 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
841 aa  62  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
332 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
822 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  32.39 
 
 
1031 aa  59.3  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
297 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
345 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
340 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 
346 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.12 
 
 
838 aa  57.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  23.64 
 
 
320 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
339 aa  57  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
337 aa  55.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
308 aa  55.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
282 aa  55.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
366 aa  55.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
345 aa  55.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
703 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 
307 aa  55.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
311 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
331 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  33.15 
 
 
301 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.15 
 
 
320 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
300 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
291 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
317 aa  52  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
346 aa  52  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
301 aa  51.6  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  26.09 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  26.09 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
489 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
302 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.58 
 
 
284 aa  51.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.92 
 
 
348 aa  49.7  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
288 aa  50.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
334 aa  50.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.86 
 
 
358 aa  49.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
330 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
472 aa  49.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
350 aa  48.9  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.83 
 
 
2401 aa  48.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
312 aa  48.5  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
619 aa  48.5  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  31.01 
 
 
288 aa  48.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  22.02 
 
 
300 aa  48.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
355 aa  47.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
691 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1982  glycosyl transferase, putative  37.88 
 
 
307 aa  47.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3156  glycosyltransferase  37.88 
 
 
307 aa  47.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1477  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
307 aa  47.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
359 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0931  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
294 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2761  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
294 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0864434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3096  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
294 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3133  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
294 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1844  putative glycosyl transferase  37.88 
 
 
294 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0724124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
477 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
312 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  48.98 
 
 
308 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
691 aa  47.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 
290 aa  47.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  26.67 
 
 
291 aa  46.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
476 aa  46.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
748 aa  47  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
337 aa  46.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.26 
 
 
322 aa  46.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
313 aa  46.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
340 aa  46.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.24 
 
 
700 aa  46.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
279 aa  46.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
307 aa  45.8  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>