65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
1182 aa  2220    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  49.74 
 
 
1192 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  48.01 
 
 
1134 aa  350  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  44.14 
 
 
1121 aa  331  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  47.02 
 
 
1196 aa  280  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
954 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
1299 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  33.85 
 
 
1112 aa  188  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
1141 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  29.51 
 
 
1031 aa  178  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
1072 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
1045 aa  173  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  35.12 
 
 
997 aa  171  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
951 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  29.98 
 
 
1074 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  31.69 
 
 
1133 aa  162  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  35.04 
 
 
1141 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
1137 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  44.65 
 
 
1299 aa  118  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  45.33 
 
 
1059 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  33.65 
 
 
1713 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
951 aa  68.6  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.67 
 
 
320 aa  65.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
318 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
340 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
329 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.32 
 
 
838 aa  56.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
401 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
822 aa  55.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
341 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
291 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
320 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
307 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
489 aa  53.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
315 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
334 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
355 aa  52.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  23.48 
 
 
320 aa  52.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
312 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
337 aa  52  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
336 aa  52.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
361 aa  52  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
312 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
307 aa  50.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  21.24 
 
 
455 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
353 aa  51.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
334 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
313 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  29.2 
 
 
262 aa  50.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
366 aa  49.3  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
317 aa  49.3  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
300 aa  48.5  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
311 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
841 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  31.78 
 
 
292 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
298 aa  46.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
286 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
290 aa  46.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  19.3 
 
 
339 aa  46.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
302 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  19.3 
 
 
339 aa  45.8  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
299 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
343 aa  45.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
302 aa  44.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  22.66 
 
 
334 aa  44.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>