23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0590 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 1133 aa  2313    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  40.51 
 
 		 1031 aa  800    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  27.35 
 
 		 1192 aa  141  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  29.01 
 
 		 1134 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  33.78 
 
 		 1121 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  34.84 
 
 		 1182 aa  108  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  25.23 
 
 		 954 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  40.11 
 
 		 1196 aa  95.5  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  36.77 
 
 		 997 aa  91.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 1141 aa  84.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 1045 aa  80.1  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 1299 aa  78.2  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 1137 aa  65.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 1072 aa  65.1  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  34.51 
 
 		 1299 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1074 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1141 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1059 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.22 
 
 		 309 aa  48.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  29.45 
 
 		 309 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  28.83 
 
 		 309 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  28.83 
 
 		 309 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>