41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5863 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  100 
 
 
1059 aa  1927    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  39.13 
 
 
1713 aa  330  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  31.88 
 
 
954 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
1137 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  45.73 
 
 
1074 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 
951 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  47.13 
 
 
997 aa  118  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  54.62 
 
 
1072 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
1045 aa  110  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  45.27 
 
 
1182 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
1196 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  31.68 
 
 
1134 aa  96.3  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 
1299 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  26.79 
 
 
1192 aa  88.2  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  43.4 
 
 
1299 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  38.33 
 
 
1031 aa  79  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
1141 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  37.58 
 
 
1112 aa  72  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  37.74 
 
 
1141 aa  68.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  41.53 
 
 
1121 aa  64.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0590  putative ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 
1133 aa  63.5  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.875026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
298 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
355 aa  54.3  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
303 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
305 aa  52.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
951 aa  52.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
300 aa  52  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
337 aa  51.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
340 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  25.74 
 
 
348 aa  49.7  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.08 
 
 
1435 aa  48.1  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.48 
 
 
838 aa  48.1  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31060  hypothetical protein  35.96 
 
 
847 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169452  normal  0.624304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.56 
 
 
320 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
616 aa  47.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
489 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  34.64 
 
 
337 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
340 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
302 aa  45.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
822 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
353 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>