54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1365 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  100 
 
 		 377 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  43.75 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  40.85 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  38.92 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  37.95 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  40.32 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  36.05 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  43.65 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  36.29 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  37.39 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  37.08 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.92 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  36.99 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  33.14 
 
 		 437 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  39.29 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  31.21 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  30.28 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30.13 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  38.7 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.21 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  31.44 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.98 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.11 
 
 		 408 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  26.3 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  30.26 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  34.33 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  30.73 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  30.4 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  32.57 
 
 		 229 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  29.49 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  31.25 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  31.48 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  31.03 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.8 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  32.76 
 
 		 225 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.41 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  29.78 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  30.34 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  30.28 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  32.48 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  28.32 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.52 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  30.48 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  28.9 
 
 		 224 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  27.48 
 
 		 211 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  25.73 
 
 		 234 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>