44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2972 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  100 
 
 		 428 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  60.41 
 
 		 442 aa  501  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  49.54 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  48.05 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  41.61 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  45.53 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  40 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  42.18 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  41.39 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  35.8 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  39.88 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  37.3 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  38.1 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  38.1 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  38.1 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  37.12 
 
 		 502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  37.17 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  34.28 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  34.5 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  32.87 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.84 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  34.03 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  33.52 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  36.3 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.94 
 
 		 468 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  34.62 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  36.56 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  27.95 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  34.76 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  25.36 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  26.88 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  29.55 
 
 		 229 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  29.45 
 
 		 374 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.59 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  25.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  33.98 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  26.9 
 
 		 205 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.48 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  27.74 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  33.09 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  27.91 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>