49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3270 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  100 
 
 		 337 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  68.24 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  53.31 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  50.73 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  49.41 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  49.38 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  32.97 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  36.36 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  32.97 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.32 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  32.65 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.82 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  30.77 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.91 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  27.87 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  32.34 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  32.82 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.94 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  30.2 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 445 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  30.46 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  30.1 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  26.47 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  32.73 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  27.91 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  31.45 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  33.33 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  25.98 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  26.32 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  28.22 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  26.87 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  30.26 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  30.26 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  26 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  26.86 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  23.17 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  26.97 
 
 		 428 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  25.83 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  33.68 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  26.75 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  39.08 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  28.33 
 
 		 425 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  25.51 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>