54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2216 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  100 
 
 		 397 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  54.57 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  51.25 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  47.68 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  48.92 
 
 		 492 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  38.94 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  44.38 
 
 		 369 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  38.79 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  39.25 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  37.73 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  38.48 
 
 		 502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  35.1 
 
 		 502 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  35.68 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  34.91 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  34.91 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  39.47 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  39.69 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  34.91 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  35.81 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  35.07 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  36.69 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  35.47 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  36.84 
 
 		 327 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  29.58 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  31 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  31.23 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.31 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.69 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  32.18 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  32.92 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  30.15 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  28.26 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  30.55 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  30.46 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  29.61 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  32.2 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  28.06 
 
 		 329 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  28.82 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  29.1 
 
 		 228 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  33.53 
 
 		 229 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 915 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  29.1 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  30.5 
 
 		 224 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  30.13 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  27.69 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  28 
 
 		 225 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  30.17 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  28.29 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.83 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  32.5 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  31.37 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>