54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2268 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  71.63 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  45.62 
 
 		 470 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  42 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  44.14 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  41.1 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  36.84 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  37.84 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  36.94 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  37.06 
 
 		 502 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  35.67 
 
 		 406 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  35.29 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  35.26 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  35.28 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  40.58 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  33.63 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  35.65 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  36.08 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  33.02 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  36.74 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  29.76 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  28.15 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  34.39 
 
 		 492 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  26.84 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  31.61 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  30 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  32.16 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  30.8 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  28.95 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  29.59 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 224 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.9 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  28.24 
 
 		 225 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 915 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.32 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  34.26 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  35.07 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  32.83 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  32.3 
 
 		 216 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  31.45 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  28.93 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  26.47 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  23.58 
 
 		 224 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  26.88 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  23.03 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  23.94 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  33.63 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>