53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1250 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  41.94 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  31.31 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  31.53 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  33.85 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  36.11 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  27.23 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  31.97 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  30.54 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  30.8 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  30.85 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  28.08 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  30.61 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  37.5 
 
 		 439 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  30.77 
 
 		 442 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  30.94 
 
 		 428 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30.9 
 
 		 366 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  33.57 
 
 		 502 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.85 
 
 		 442 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  32.14 
 
 		 369 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  34.29 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.13 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  29.17 
 
 		 445 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  30.71 
 
 		 313 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3129  hypothetical protein  33.85 
 
 		 322 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 502 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 408 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.12 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  26.86 
 
 		 392 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  28.25 
 
 		 399 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0063  hypothetical protein  27.93 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  30.61 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 915 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  27.68 
 
 		 399 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  34.11 
 
 		 425 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  25.55 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  35.29 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.23 
 
 		 470 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  32 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  30.34 
 
 		 411 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  31.62 
 
 		 390 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  25.17 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  25.61 
 
 		 407 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  26.29 
 
 		 392 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  36.88 
 
 		 397 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  26.29 
 
 		 392 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  37.89 
 
 		 444 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>