39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1522 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  100 
 
 		 374 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  39.39 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  31.64 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  33.21 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  29.6 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  37.43 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  28.62 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  27.42 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.2 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  26.55 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  27 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  30.91 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  27.03 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  25.4 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  31.98 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  25.34 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  25.27 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  30.35 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  25.52 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  25.52 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  28.02 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  32.89 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  25.56 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  29.49 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  26.75 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  29.59 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  23.87 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  27.65 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  29.14 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  29.7 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  25.11 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.23 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  32.31 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  28.06 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  28.9 
 
 		 284 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>