59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1996 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  100 
 
 		 442 aa  874    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  59.95 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  54.57 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  48.77 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  40 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  38.14 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  45.79 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  41.02 
 
 		 390 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  34.29 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  34.31 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  34.31 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  34.31 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  36.04 
 
 		 327 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  34.02 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  39.1 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  34.43 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  39.67 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  34.24 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  35.01 
 
 		 366 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  37.86 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  37.54 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  34.18 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.04 
 
 		 468 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  27.96 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.31 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  29.51 
 
 		 313 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  34.95 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  29.12 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  30.14 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  28.02 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  27.96 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  27.81 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  28.05 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  31.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  31.05 
 
 		 284 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  28.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.01 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  31.67 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  26.14 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  29.93 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  29.37 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  27.94 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  28.16 
 
 		 229 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  32.2 
 
 		 269 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  27.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  28.57 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  25.89 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  28.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  26 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  26 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 915 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  29 
 
 		 329 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>