40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3562 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  80.65 
 
 		 399 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  74.23 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  74.23 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  75.53 
 
 		 392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  42.03 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  38.71 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  34.03 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  40.2 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.58 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  40 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  38.67 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  37.34 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  33.05 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  32.77 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  35.18 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  35.6 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  32.02 
 
 		 502 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  36.42 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  35.74 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  33.14 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  36.55 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  34.42 
 
 		 492 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  28.48 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  33.46 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.92 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  27.57 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  25.88 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  26.55 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.29 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.13 
 
 		 252 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  33.03 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  25.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  25.45 
 
 		 224 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  25.99 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  28.14 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  27.68 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  28.9 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>