47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1689 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  38.34 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  38.73 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  34.52 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  35.45 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  33.85 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  33.79 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  31.22 
 
 		 329 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  31.28 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  30.62 
 
 		 337 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  32.16 
 
 		 339 aa  85.5  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.21 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  28.64 
 
 		 338 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.71 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  31.72 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  28.95 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  24.24 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  30.66 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 406 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  24.49 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  25.45 
 
 		 399 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  25.84 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  29.93 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  29.93 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  26.14 
 
 		 442 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  22.96 
 
 		 399 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  29.61 
 
 		 377 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  23.77 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  27.52 
 
 		 425 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 404 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  21.99 
 
 		 468 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  27.62 
 
 		 397 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  28.92 
 
 		 470 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  24.48 
 
 		 388 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  24.34 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  26.28 
 
 		 347 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  26.92 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 502 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  25.95 
 
 		 408 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  27.1 
 
 		 492 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2297  hypothetical protein  26.03 
 
 		 355 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.589698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  24.2 
 
 		 407 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  27.04 
 
 		 411 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  27.73 
 
 		 437 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>