50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0319 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  100 
 
 		 502 aa  981    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  91.54 
 
 		 502 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  49.78 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  40.75 
 
 		 442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  40.92 
 
 		 369 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.19 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  37.75 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  38.81 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  36.78 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  38.08 
 
 		 377 aa  174  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  39.03 
 
 		 369 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  32.31 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  38.64 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  34.25 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  36.81 
 
 		 366 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  36.97 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  32.89 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  33.23 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  33.23 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  33.23 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  31.71 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.85 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  36.5 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  29.07 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  31.41 
 
 		 347 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  29.28 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  32.23 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.63 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.94 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  29.27 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  27.94 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  28.07 
 
 		 252 aa  62  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  28.43 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  33.57 
 
 		 228 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  30.08 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.95 
 
 		 225 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  30.05 
 
 		 338 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  27.02 
 
 		 339 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  28.65 
 
 		 234 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  25.54 
 
 		 205 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  23.67 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  27.92 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  28.67 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  27.09 
 
 		 211 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  31.49 
 
 		 229 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  25.36 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  33.04 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.85 
 
 		 226 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 915 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>