45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2176 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  74.67 
 
 		 225 aa  338  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  38.34 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  32.88 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  35.91 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  35.58 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  40.94 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  27.23 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.69 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  29.35 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  30.16 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  27.87 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  27.91 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  30.43 
 
 		 338 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  29.24 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  25.87 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  30.57 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  27.51 
 
 		 406 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  29.49 
 
 		 366 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 502 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  26.22 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  23.5 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  26.98 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  27.89 
 
 		 442 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  31.4 
 
 		 390 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  27.22 
 
 		 468 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  28.83 
 
 		 347 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  25.42 
 
 		 327 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 502 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 397 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  29.37 
 
 		 442 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  37.35 
 
 		 388 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  28.77 
 
 		 425 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  33.98 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 915 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  28.03 
 
 		 428 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  24.38 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  32.2 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  28.8 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  26.32 
 
 		 399 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  26.84 
 
 		 399 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2297  hypothetical protein  29.6 
 
 		 355 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.589698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>