17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2297 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  695    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.589698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  56.59 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  27.41 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  25.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  29.75 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  26.63 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  26.63 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  31.67 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  34.92 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  29.19 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  32 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  30.09 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>