28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  32 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  32.62 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  28.71 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  29.21 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.55 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  30.16 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  27.64 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  29.91 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  27.18 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.02 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  27.14 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  26.45 
 
 		 369 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  26.11 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  28.51 
 
 		 442 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  29.59 
 
 		 428 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  26.81 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  27.08 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  27.13 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  27.75 
 
 		 397 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  27.83 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  28.21 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  29.85 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  25.42 
 
 		 406 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  29.2 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  25.12 
 
 		 445 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  30.4 
 
 		 502 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>