46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5989 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  100 
 
 		 445 aa  890    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  50.93 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  50.36 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  40.29 
 
 		 369 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  38.83 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  37.53 
 
 		 442 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  36.47 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  35.16 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  34.29 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  36.86 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  35.55 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  39.69 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  38.81 
 
 		 390 aa  163  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  35.03 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  34.8 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  35.38 
 
 		 406 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  32.25 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  33.53 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  33.53 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  32.16 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  33.24 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.42 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  33.65 
 
 		 347 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  29.86 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  27.22 
 
 		 313 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  31.4 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  30.1 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  25.88 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  30.13 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  31.19 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  26.3 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  32.35 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  30.94 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  29.64 
 
 		 337 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  50.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  25.6 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  29.08 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  24.53 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  25.9 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  26.15 
 
 		 338 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  25.12 
 
 		 226 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>