24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0500 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0063  hypothetical protein  38.32 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  38.07 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1011  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.294908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  31.18 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  28.41 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  29.73 
 
 		 347 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 915 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  30.54 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  30.26 
 
 		 445 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  28.07 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  29.44 
 
 		 442 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  27.07 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  27.07 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  35.48 
 
 		 407 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  32.52 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  35.03 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.67 
 
 		 442 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  28.99 
 
 		 399 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  31.35 
 
 		 470 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  28.09 
 
 		 397 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>