57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3715 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  43.37 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  45.13 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  41.67 
 
 		 442 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  38.42 
 
 		 502 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  38.99 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  43.26 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  38.19 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  45.34 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  40.33 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  43.2 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  40.98 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  40 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  39.02 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  39.02 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  39.58 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  38.83 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  38.65 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  43.97 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  39.13 
 
 		 437 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  39.94 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  37.54 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  40.66 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  35.56 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  33.06 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  31.34 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  31.89 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  34.07 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  33.17 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  32.79 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  33.5 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  32.49 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  33.67 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  32.38 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  28.5 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  29.46 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  32.2 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  29 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  34.29 
 
 		 228 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  31.07 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  32.51 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0864  hypothetical protein  33.7 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00288723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  35.03 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  30.81 
 
 		 205 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  28.31 
 
 		 224 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  33.61 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  25 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  35.42 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  46.2  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  32.68 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  30.38 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  32.18 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  30.4 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>