58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1985 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  100 
 
 		 470 aa  934    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  56.51 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  41.48 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  39.68 
 
 		 425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  41.42 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  45.62 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  39.56 
 
 		 369 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  33.97 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  47.91 
 
 		 369 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  36.97 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  36.03 
 
 		 502 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  36.34 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  36.58 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  37.72 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  38.81 
 
 		 392 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  38.81 
 
 		 392 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  37.57 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  38.81 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  38.27 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  37.86 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  36.92 
 
 		 377 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  38.21 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  37.7 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  38.08 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  31.97 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  30.09 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.49 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.98 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  31.55 
 
 		 216 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 337 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  29.86 
 
 		 252 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  35.54 
 
 		 339 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  34.03 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  28.71 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  28.09 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.95 
 
 		 225 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  29.84 
 
 		 338 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  31.35 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  27.71 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  28.85 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  32.24 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  28.57 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  26.64 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  34.24 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  25.5 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  25.47 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  25.5 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 915 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  29.51 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.33 
 
 		 1888 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  30.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  30.23 
 
 		 267 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>