40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3055 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  98.98 
 
 
392 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  77.16 
 
 
399 aa  597  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  74.23 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  39.94 
 
 
442 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  37.42 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  34.02 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  38.81 
 
 
470 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  38.14 
 
 
428 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  38.36 
 
 
369 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  38.49 
 
 
377 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  32.77 
 
 
406 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  37.21 
 
 
388 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  33.54 
 
 
502 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  33.89 
 
 
425 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  33.23 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  32.31 
 
 
502 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
397 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  35.76 
 
 
390 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  32.89 
 
 
437 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  33.53 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  34.9 
 
 
492 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  30.56 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.33 
 
 
327 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  32.6 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  28.15 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  25.65 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.81 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  30.47 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  26.01 
 
 
205 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  26.06 
 
 
225 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  29.93 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  26.36 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  26.46 
 
 
252 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  27.07 
 
 
219 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  27.36 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  31.84 
 
 
229 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>