11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2611 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 915 aa  1890    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  25.97 
 
 		 218 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 		 456 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  48.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  29.82 
 
 		 369 aa  48.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1276 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  25.67 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30.47 
 
 		 366 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  25.94 
 
 		 442 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  26.04 
 
 		 444 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  25.29 
 
 		 397 aa  44.3  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>