45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  100 
 
 		 468 aa  927    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  39.06 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  33.47 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  40.24 
 
 		 366 aa  200  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  36.34 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  34.82 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30 
 
 		 406 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.04 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  32.06 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  31.69 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  31.35 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  32.12 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  32.55 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  31.23 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  34.69 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  30.63 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  30.63 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  29.85 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  28.44 
 
 		 399 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  31.53 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.21 
 
 		 347 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  31.71 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  28.48 
 
 		 327 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  30.72 
 
 		 445 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  40.26 
 
 		 313 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  32.73 
 
 		 492 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  27.98 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  34.87 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  33.55 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  23.95 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  31.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  28.04 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  29.1 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  30.05 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  28.28 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  36.73 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  27.93 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  26.62 
 
 		 224 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  28.27 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  21.99 
 
 		 224 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>