37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1405 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  663    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  68.24 
 
 
337 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  52.06 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  50.58 
 
 
337 aa  296  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  47.63 
 
 
336 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  44.91 
 
 
329 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  31.97 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  30.73 
 
 
234 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  34.72 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  31.09 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.28 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  30.84 
 
 
404 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  32.3 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  34.65 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  33.51 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.17 
 
 
225 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  28.64 
 
 
224 aa  59.3  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.14 
 
 
226 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  28.44 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.22 
 
 
411 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  32.2 
 
 
369 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  29 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  28.86 
 
 
439 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  28.78 
 
 
267 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  31.16 
 
 
444 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  26.34 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  25.7 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  30.06 
 
 
502 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  28.06 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  27.37 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.36 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  30.91 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  38.36 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  31.36 
 
 
216 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  26.15 
 
 
445 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  28.71 
 
 
502 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  29.29 
 
 
273 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>