47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4278 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  100 
 
 		 404 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  36.01 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  32.27 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  30.88 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  29.28 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.48 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  29.43 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  33.82 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  33.51 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  34.03 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  30.37 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  27.49 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  28.17 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  33.84 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  35.38 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  28.5 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  25.86 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  25.37 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30.14 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  31.86 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  26.8 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.12 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  27.6 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  36.79 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  29.79 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  27.02 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  25.86 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  25.86 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  28.19 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  29.6 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  26.03 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  28.44 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  32.97 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  27.89 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  28.36 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  26.9 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  31.1 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  31.86 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  28.3 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  27.73 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  29.77 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  27.52 
 
 		 224 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  26.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>