20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1238 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  100 
 
 		 382 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  31.38 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  35.27 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  33.69 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  32.62 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  33.61 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.49 
 
 		 468 aa  53.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  31.67 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  30.39 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  29.49 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.42 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  28.65 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  28.62 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  31.41 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  30.68 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>