37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1408 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  645    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  58.11 
 
 
339 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  52.19 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  50.73 
 
 
337 aa  301  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  50.58 
 
 
338 aa  296  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  47.43 
 
 
329 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  31.37 
 
 
234 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  30.62 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  35.75 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  28.71 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  32.45 
 
 
205 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.8 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  31.61 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  36.49 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  35.29 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  29.15 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.31 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  30.08 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  35.79 
 
 
439 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  29.35 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  35 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  29.25 
 
 
445 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  31.86 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.63 
 
 
252 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  29.64 
 
 
442 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.16 
 
 
468 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  30.29 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  31.65 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
444 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  30.23 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  29.57 
 
 
456 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  26.42 
 
 
502 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0405  FHA domain containing protein  24.73 
 
 
490 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.65 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  30.86 
 
 
502 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>