44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2469 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  49.61 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  39.9 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  36.92 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  35 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  32.59 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  26.99 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  26.99 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  26.36 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  26.91 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.05 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.9 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  30.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 428 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  26.48 
 
 		 502 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  30.5 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  26.4 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  43.04 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  26.22 
 
 		 425 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  28.97 
 
 		 404 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  28.93 
 
 		 492 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  31.21 
 
 		 388 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  30.05 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  29.73 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  29.2 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  25.81 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  30.71 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  31.62 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  27.02 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  25.88 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  29.49 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  29.29 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  26.72 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  27.86 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  25.63 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  26.91 
 
 		 442 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  25.63 
 
 		 392 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  25.63 
 
 		 392 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  32.03 
 
 		 470 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  27.66 
 
 		 399 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  38.2 
 
 		 335 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>