17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4306 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  46.5 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  42.67 
 
 
287 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  42.72 
 
 
273 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  39.11 
 
 
273 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  35.16 
 
 
284 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  30.74 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07980  Protein of unknown function (DUF2510)  40 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0996646  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  36.29 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  28.63 
 
 
409 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  28.63 
 
 
409 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  28.24 
 
 
418 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  31.36 
 
 
439 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  33.66 
 
 
444 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
456 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  30.28 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  32.86 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>