18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  100 
 
 		 329 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  47.73 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  35.27 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  36.95 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  35.47 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  32.27 
 
 		 267 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  35.23 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  32.88 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  24.62 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  24.62 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07980  Protein of unknown function (DUF2510)  28.89 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0996646  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  22.49 
 
 		 418 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  28.76 
 
 		 366 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  32.61 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  25.55 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  25.09 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.71 
 
 		 442 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>