119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3945 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3945  transposase  100 
 
 		 145 aa  303  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  87.3 
 
 		 498 aa  235  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  92.5 
 
 		 138 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  68.61 
 
 		 497 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  68.61 
 
 		 502 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  70.54 
 
 		 203 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  42.06 
 
 		 493 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  42.06 
 
 		 493 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  39.86 
 
 		 558 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32.54 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  38.97 
 
 		 534 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  38.97 
 
 		 534 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  39.84 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  35.51 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  35.51 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  35.51 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  35.51 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  36.96 
 
 		 565 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  36.96 
 
 		 565 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  36.96 
 
 		 565 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  36.96 
 
 		 565 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  37.82 
 
 		 555 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  37.82 
 
 		 539 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  36.15 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4327  integrase catalytic region  44.59 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 506 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  36.23 
 
 		 584 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  34.88 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  35.04 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  35.96 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  35.96 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 503 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 503 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 503 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  33.08 
 
 		 509 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  35.96 
 
 		 500 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  30.53 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  34.07 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  32.03 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  37.23 
 
 		 499 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  37.23 
 
 		 499 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  37.23 
 
 		 499 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  34.4 
 
 		 503 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  34.68 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  33.85 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 499 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 499 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 499 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  39.08 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  39.08 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  39.08 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  39.08 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  31.06 
 
 		 496 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  32.81 
 
 		 505 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  32.81 
 
 		 505 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  32.81 
 
 		 505 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  32.81 
 
 		 505 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  36.05 
 
 		 501 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  35.56 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  34.15 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 504 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 501 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 501 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  32.03 
 
 		 499 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 499 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 499 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  35.53 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  41.67 
 
 		 494 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 508 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  35.29 
 
 		 464 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  37.66 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  37.66 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  37.66 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  35.29 
 
 		 323 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 499 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  33.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  28.89 
 
 		 509 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  28.89 
 
 		 509 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>