More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1802 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1659  transposase  98.4 
 
 
323 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  100 
 
 
464 aa  951    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  100 
 
 
309 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  99.66 
 
 
309 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  99.66 
 
 
309 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  50.77 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0315  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237775  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0027  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.15559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0707  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0484002  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1656  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  38.53 
 
 
493 aa  306  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  38.53 
 
 
493 aa  306  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  38.43 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  38.43 
 
 
507 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  38.64 
 
 
500 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  37.92 
 
 
504 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  37.92 
 
 
504 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  36.14 
 
 
501 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  36.14 
 
 
501 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  36.14 
 
 
501 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  36.14 
 
 
501 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  34.13 
 
 
501 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  39.67 
 
 
334 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
501 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  33.51 
 
 
501 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.72 
 
 
494 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.72 
 
 
494 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.72 
 
 
494 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.72 
 
 
494 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  30.75 
 
 
504 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  29.57 
 
 
499 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  29.57 
 
 
499 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  29.57 
 
 
499 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  35.32 
 
 
558 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32 
 
 
442 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  32.66 
 
 
498 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  36.99 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  36.99 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  36.99 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  33.7 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  36.99 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  31.09 
 
 
502 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  31.09 
 
 
497 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  35.23 
 
 
584 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  34.21 
 
 
534 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  34.21 
 
 
534 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  34.21 
 
 
534 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  30.79 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  26.67 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  30.1 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  30.1 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  30.1 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  30.1 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  28.75 
 
 
529 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 
499 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 
499 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  40.76 
 
 
160 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.01 
 
 
499 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  30.2 
 
 
488 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  30.28 
 
 
502 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  30.28 
 
 
502 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  30.28 
 
 
502 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  29.1 
 
 
499 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  29.1 
 
 
499 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  28.81 
 
 
502 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  28.24 
 
 
509 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  28.24 
 
 
509 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 
499 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 
499 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 
499 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  27.14 
 
 
496 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  31.97 
 
 
555 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  31.97 
 
 
539 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  28.96 
 
 
503 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  28.96 
 
 
503 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  28.96 
 
 
503 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  31.88 
 
 
556 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  29.84 
 
 
502 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  26.58 
 
 
507 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0339  hypothetical protein  32.39 
 
 
387 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  30.59 
 
 
468 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 
501 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  28.29 
 
 
501 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  27.25 
 
 
504 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  28.83 
 
 
503 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>