More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1799 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1799  transposase  100 
 
 
507 aa  1031    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  98.22 
 
 
507 aa  1016    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  98.2 
 
 
500 aa  999    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  50.1 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  50.1 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  41.52 
 
 
494 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  38.43 
 
 
464 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  32.3 
 
 
504 aa  223  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  32.3 
 
 
504 aa  223  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  31.24 
 
 
501 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  41.59 
 
 
323 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  41.1 
 
 
309 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  41.1 
 
 
309 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  33.18 
 
 
501 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  41.92 
 
 
309 aa  206  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  30.85 
 
 
501 aa  203  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  30.85 
 
 
501 aa  203  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  30.85 
 
 
501 aa  203  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  30.85 
 
 
501 aa  203  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  32.29 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  35.76 
 
 
334 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  32.9 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  32 
 
 
497 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  29.93 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  30.05 
 
 
499 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  30.05 
 
 
499 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  30.05 
 
 
499 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  31.46 
 
 
498 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  31.55 
 
 
501 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  31.55 
 
 
501 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  29.06 
 
 
494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  29.06 
 
 
494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  29.06 
 
 
494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  29.06 
 
 
494 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.64 
 
 
504 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  29.95 
 
 
497 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  29.23 
 
 
507 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  30.3 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  30.3 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  30.3 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  30.3 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  28.48 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  28.28 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  28.28 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  29.52 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  29.52 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  29.76 
 
 
508 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  27.16 
 
 
502 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  24.95 
 
 
506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  28.92 
 
 
504 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  29.43 
 
 
505 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  29.43 
 
 
505 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  29.43 
 
 
505 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  29.43 
 
 
505 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  32.54 
 
 
509 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.75 
 
 
496 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 
508 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  28.16 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  27.63 
 
 
499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  28.16 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 
509 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 
509 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
504 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
504 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  29.94 
 
 
468 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
501 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  28.44 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  28.44 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 
373 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  24.75 
 
 
503 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  24.75 
 
 
503 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  24.55 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  26.16 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  26.16 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  26.16 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  27.5 
 
 
501 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>