More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0028 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0314  transposase  100 
 
 		 309 aa  636    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  100 
 
 		 309 aa  636    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  99.03 
 
 		 309 aa  630  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  99.66 
 
 		 464 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  98.63 
 
 		 323 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  51.56 
 
 		 494 aa  274  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  41.46 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  41.46 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  41.1 
 
 		 507 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  41.92 
 
 		 507 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  42.27 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  40.13 
 
 		 501 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  40.13 
 
 		 501 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  40.13 
 
 		 501 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  40.13 
 
 		 501 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  38.14 
 
 		 501 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  41.86 
 
 		 504 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  41.86 
 
 		 504 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  36.13 
 
 		 501 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  35.53 
 
 		 501 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  36.64 
 
 		 498 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  34.64 
 
 		 497 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  34.66 
 
 		 442 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  34.64 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  33.7 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  33.7 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  33.7 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  33.7 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  38.96 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  39.57 
 
 		 565 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  39.57 
 
 		 565 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  39.57 
 
 		 565 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  39.57 
 
 		 565 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  37.25 
 
 		 558 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  29.45 
 
 		 504 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  30.26 
 
 		 499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  30.26 
 
 		 499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  30.26 
 
 		 499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  39.08 
 
 		 584 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.73 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  33.99 
 
 		 534 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  33.99 
 
 		 534 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  33.99 
 
 		 534 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  29.21 
 
 		 529 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  30.19 
 
 		 499 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 506 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  35.71 
 
 		 468 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 502 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  32.19 
 
 		 488 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 503 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 503 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 503 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  31.66 
 
 		 502 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  31.66 
 
 		 502 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  31.66 
 
 		 502 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 501 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 499 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0339  hypothetical protein  35.5 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 		 373 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 499 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 499 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  30.4 
 
 		 503 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 499 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 499 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  28.1 
 
 		 496 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  28.87 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  30.31 
 
 		 504 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  30.31 
 
 		 504 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  31.85 
 
 		 564 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  28.1 
 
 		 496 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 496 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  32.47 
 
 		 449 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  32.47 
 
 		 449 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.1 
 
 		 496 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>