More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4458 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  100 
 
 
442 aa  913    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  41.38 
 
 
494 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  41.38 
 
 
494 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  41.38 
 
 
494 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  41.38 
 
 
494 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  38.11 
 
 
499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  38.11 
 
 
499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  38.11 
 
 
499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  35.88 
 
 
497 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  35.88 
 
 
502 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  33.41 
 
 
498 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  35.9 
 
 
509 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  34.44 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  33.92 
 
 
497 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  34.95 
 
 
565 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  34.95 
 
 
565 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  34.95 
 
 
565 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  34.95 
 
 
565 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  34.8 
 
 
558 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  34.88 
 
 
534 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  34.88 
 
 
534 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  34.88 
 
 
534 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  33.11 
 
 
503 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  33.11 
 
 
503 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  33.11 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  32.63 
 
 
509 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  32.63 
 
 
509 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  32.29 
 
 
503 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  32.05 
 
 
504 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  33.09 
 
 
501 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  33.41 
 
 
584 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
504 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  31.9 
 
 
508 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  31.9 
 
 
508 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
508 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 
501 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
501 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  33.19 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  33.19 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  32.14 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  32.14 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
508 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
508 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
507 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
507 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
507 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
507 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  32.38 
 
 
502 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  31.84 
 
 
496 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  31.7 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 
510 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 
510 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 
510 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 
510 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 
504 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  31.53 
 
 
488 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 
504 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 
504 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  31.03 
 
 
497 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  31.03 
 
 
497 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  31.03 
 
 
497 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  32.53 
 
 
503 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  31.39 
 
 
496 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  31.39 
 
 
496 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  32.96 
 
 
499 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  31.04 
 
 
505 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  33.12 
 
 
564 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  31.04 
 
 
505 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  31.04 
 
 
505 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  31.04 
 
 
505 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  32.76 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  32.76 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  32.76 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  32.76 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
499 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
499 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
499 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
499 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
499 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>