More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3483 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  97.16 
 
 		 423 aa  848    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  76.45 
 
 		 502 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  76.45 
 
 		 502 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  65.74 
 
 		 501 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  76.45 
 
 		 502 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  82.11 
 
 		 504 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  82.11 
 
 		 504 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  65.74 
 
 		 501 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 501 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  58.27 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  57.06 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  57.06 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  57.06 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  57.66 
 
 		 496 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  56.05 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  56.05 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  54.53 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  54.8 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  54.2 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5105  hypothetical protein  79.31 
 
 		 290 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  48.89 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  48.89 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  48.89 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  48.89 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  46.06 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  44.8 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  44.4 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  44.4 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  41.37 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  43.92 
 
 		 508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  43.51 
 
 		 508 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 		 508 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  40.6 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  42.54 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  43.58 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  43.58 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  43.58 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  43.58 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 		 508 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 		 508 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  41.52 
 
 		 509 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  41.52 
 
 		 509 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  43.66 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  43.66 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  41.95 
 
 		 507 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  42.07 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  42.07 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  42.07 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  42.07 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  42.92 
 
 		 488 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  40.32 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  40.32 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  40.32 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5110  hypothetical protein  85.06 
 
 		 199 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122941  normal  0.136795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  53.99 
 
 		 356 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  31.49 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  31.49 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  31.49 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  31.49 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  32.85 
 
 		 497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  30.13 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  32.64 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  31.52 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  34.12 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  34.12 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  34.12 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  33.56 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  32.55 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  29.08 
 
 		 504 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>