More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1016 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1175  IstA2  100 
 
 		 499 aa  1032    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  100 
 
 		 499 aa  1032    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  100 
 
 		 499 aa  1032    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  38.11 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  37.9 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  34.58 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  34.58 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  34.58 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  34.58 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  36.84 
 
 		 558 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  35.02 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  34.8 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  37.37 
 
 		 565 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  37.37 
 
 		 565 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  37.37 
 
 		 565 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  37.37 
 
 		 565 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  35.94 
 
 		 584 aa  250  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  37.55 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  37.55 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  37.34 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  32.44 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  32.98 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  32.67 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  33.54 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  33.05 
 
 		 499 aa  233  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.91 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  32.6 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  32.6 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  32.6 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  33.2 
 
 		 502 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  32.61 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  32.61 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  34.93 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  34.93 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  35.79 
 
 		 556 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.59 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.59 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  35.65 
 
 		 555 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  30.98 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  30.98 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  30.98 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  31.4 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  31.4 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  34.67 
 
 		 564 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  33.75 
 
 		 507 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  33.47 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  35.08 
 
 		 539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  33.12 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  33.12 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  32.63 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  32.63 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  32.05 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  31.71 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  31.71 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  31.71 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  31.71 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  30.65 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 496 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  30.66 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 496 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  31.93 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  31.93 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  31.93 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  31.93 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 501 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 501 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 501 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 501 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 501 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>