227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2954 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  80 
 
 		 504 aa  271  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  80 
 
 		 504 aa  271  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  57.52 
 
 		 501 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  51.3 
 
 		 501 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  51.3 
 
 		 501 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  51.3 
 
 		 501 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  51.3 
 
 		 501 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  51.3 
 
 		 334 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  44.37 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  40.76 
 
 		 309 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  40.76 
 
 		 309 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  40.76 
 
 		 464 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  40.76 
 
 		 309 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  40.76 
 
 		 323 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  41.06 
 
 		 501 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  39.35 
 
 		 493 aa  104  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  39.35 
 
 		 493 aa  104  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  44.83 
 
 		 494 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  38.41 
 
 		 507 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  38.41 
 
 		 500 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  38.41 
 
 		 507 aa  94  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  34.62 
 
 		 499 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  34.62 
 
 		 499 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  34.62 
 
 		 499 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  33.55 
 
 		 509 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  33.59 
 
 		 504 aa  80.9  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  34.23 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  34.23 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  34.23 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  34.23 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  32.87 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  32.87 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  32.87 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  32.9 
 
 		 558 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  35.17 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  31.13 
 
 		 496 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  31.13 
 
 		 496 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  31.13 
 
 		 496 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  32.5 
 
 		 488 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  28.1 
 
 		 529 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.5 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.5 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.5 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.5 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  30.32 
 
 		 584 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  29.68 
 
 		 565 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  29.68 
 
 		 565 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  29.68 
 
 		 565 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  29.68 
 
 		 565 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  29.49 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  29.49 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  29.49 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  26.45 
 
 		 497 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  32.69 
 
 		 508 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  25.81 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 510 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 510 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 510 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 510 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  27.63 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  28.08 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  27.74 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  27.74 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  30.95 
 
 		 503 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 504 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 504 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  30 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  27.27 
 
 		 556 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  27.45 
 
 		 504 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  29.61 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  29.61 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  30.77 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  29.14 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  27.63 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>